早在2005年7月17日，中共中央总书记胡锦涛致电马英九，祝贺他当选为中国国民党主席，贺电全文如下：
台北中国国民党中央委员会马英九先生：
值此先生当选中国国民党主席之际，谨致祝贺。由衷期望贵我两党与两岸同胞一道，继续为推动两岸关系和平稳定发展、共创中华民族美好未来而努力。
中国共产党中央委员会总书记 胡锦涛
在2009年7月27日中共中央总书记胡锦涛致电，祝贺马英九当选中国国民党下任主席，贺电全文如下：
台北，中国国民党中央委员会马英九先生：
值此先生当选中国国民党主席之际，谨致祝贺。由衷期望贵我两党继续推动两岸关系和平发展，进一步深化政治互信，不断为两岸同胞谋福祉，开创中华民族的伟大复兴。
中国共产党中央委员会总书记 胡锦涛
对此，马英九回电，全文如下：
北京 中国共产党中央委员会总书记
胡锦涛先生惠鉴：
今日贺电敬悉，谨致谢忱。
四年来，经过贵我两党的共同努力，当前两岸关系已在“九二共识”的基础上，走上和平发展、稳定共荣的大道，既符合两岸人民的期望，也赢得世界各国的肯定。
今后，仍须双方顺应民意，继续在“正视现实、建立互信、搁置争议、共创双赢”的原则下，不断努力，以巩固海峡和平、重建区域稳定、促进两岸持续发展与繁荣。端此奉复，敬颂
时祺
马英九敬启
中华国民
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